如果您的苹果短信全部已读，但仍然显示有数字未读，这可能是由以下几个原因导致的。
1、软件错误或系统缓存问题：有时，手机的操作系统可能会出现错误，导致短信计数不准确，您可以尝试重启设备，这通常可以解决一些临时性的软件问题。
2、未删除短信对话：虽然您可能已经阅读了所有短信，但如果未删除相关的短信对话，计数可能会继续显示，请检查短信应用中的对话，确保已删除不再需要的对话。
3、通知设置问题：检查您的通知设置，确保短信应用中的通知已正确设置，有时，即使短信已读，通知仍然会显示未读计数，特别是在通知被暂停或关闭重新打开时。
4、第三方应用干扰：如果您安装了第三方短信应用或其他相关应用，这些应用可能会干扰正常的短信功能，尝试关闭这些应用或卸载它们，然后查看问题是否解决。
如果以上方法都无法解决问题，建议您联系苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求帮助，他们可能能够提供更具体的解决方案或建议。
