如果在使用苹果手机时，自动输入的验证码在短信中被删除了，可以尝试以下几种方法来恢复或处理这个问题。
1、检查通知设置：确保手机通知设置中的提醒功能已开启，以便接收短信验证码通知，如果通知被关闭或设置为静默通知，可能会导致无法及时看到验证码。
2、检查短信应用：确保短信应用没有被意外关闭或退出，有时，验证码可能会在应用关闭后丢失，重新打开短信应用并检查是否有未读消息。
3、检查自动填充功能：确认手机的自动填充功能是否已开启，如果自动填充功能已开启，当接收到验证码时，系统会自动填充到相应的输入框中，如果验证码被删除，可能是因为自动填充后用户未注意或误删了短信。
4、检查最近删除或垃圾箱：苹果手机上的短信应用可能有一个“最近删除”或“垃圾箱”的文件夹，在其中可以找回最近删除的短信，进入该文件夹查看是否有验证码短信。
5、联系服务提供商：如果以上方法均无效，可以尝试联系手机运营商或服务提供商，询问他们是否有恢复已删除短信的方法，他们可能无法直接恢复验证码，但可以协助查找相关记录或提供其他建议。
如果验证码已经被删除，可能无法直接恢复，为了避免类似情况再次发生，建议接收验证码时暂时关闭自动填充功能，以确保不会误删验证码短信，希望以上方法能帮助解决问题，如有更多疑问可咨询苹果官方客服获得更多帮助。
