苹果验证码短信凭空消失可能有以下几种原因。
1、网络延迟或系统问题导致短信发送延迟或未成功发送，此时可以尝试重新获取验证码，并确保手机信号良好，如果是系统问题，可能需要等待一段时间或联系苹果客服解决。
2、手机设置问题，手机开启了陌生短信拦截功能，验证码可能被拦截，此时需要检查手机设置，确保没有拦截重要短信的选项。
3、运营商的问题，有时运营商的服务器出现问题，也会导致验证码短信无法正常接收，可以尝试联系运营商客服咨询情况。
4、短信保存字符达到上限，普通短信的字符限制在70个左右，如果收到的验证码短信内容超过了这一限制，部分手机可能会自动将其分割成两条短信进行显示，但部分手机只会显示一条，然后另一条被分割的短信可能会凭空消失，遇到这样的情况，可以尝试清空短信缓存或删除部分短信来解决问题。
原因可能导致验证码短信消失的问题，建议逐一排查以找到具体原因并解决，如果问题仍未解决，建议联系苹果客服以获得进一步的帮助。
