短信会莫名消失的原因可能有以下几点。
1、可能是手机内存不足导致的短信消失，手机内存不足会导致短信无法被正常保存，从而出现消失的情况，此时可以清理手机内存空间，删除一些不需要的文件和应用程序。
2、可能是手机短信缓存问题导致的短信消失，在手机使用过程中，短信缓存可能会被清除或者被其他应用程序占用，从而导致短信消失，此时可以尝试清除短信缓存或者重启手机。
3、可能是手机应用程序版本过低导致的短信消失，一些旧版本的应用程序可能存在漏洞或者不稳定性，从而导致短信无法被正常保存，此时可以尝试升级应用程序版本或者重新安装应用程序。
4、手机病毒感染也可能导致短信消失，病毒会破坏手机系统文件，导致短信无法被正常读取和保存，此时可以使用杀毒软件进行扫描和清除病毒。
5、如果手机使用的是双卡双待手机，可能存在短信接收错误的情况，导致短信误删或消失，此时可以检查短信接收是否正确，并确认是否误删短信。
还有一些其他原因可能导致短信消失，例如手机系统问题、短信服务运营商问题等，如果以上方法都无法解决问题，建议联系手机制造商或运营商寻求帮助。
