如果您的苹果手机短信总是显示未读标志，即使您已经阅读并回复了所有的短信，这可能是由于以下几个原因造成的。
1、短信应用未完全同步或刷新：短信应用可能因为各种原因未能完全同步或刷新，导致已经阅读的短信仍然显示为未读状态，您可以尝试关闭短信应用，然后重新打开，看看问题是否得到解决。
2、通知设置问题：检查您的通知设置，确保您已经为短信应用启用了正确的通知选项，如果您关闭了通知或某些通知选项，可能会导致短信显示为未读状态，您可以前往“设置”>“通知”，找到短信应用并确保其通知已启用。
3、软件问题：这种问题可能是由于软件问题导致的，您可以尝试重启您的手机，看看问题是否得到解决，如果问题仍然存在，您可以考虑更新您的iOS系统到最新版本，或者联系苹果客服寻求帮助。
4、短信本身的问题：某些特定的短信可能会出现问题，导致它们无法正常标记为已读，您可以尝试删除这些短信并重新接收，看看问题是否得到解决。
如果以上方法都无法解决问题，建议您联系苹果客服或前往附近的苹果专卖店寻求进一步的帮助和支持。
