小米短信加密的设置可以通过以下步骤完成。
1、打开手机“设置”。
2、找到并点击“应用锁”选项。
3、在弹出的提示中输入设置的应用锁密码或使用指纹识别解锁。
4、找到并点击“短信”应用的开关，即可完成加密设置，之后进入短信应用需要验证设置的密码或指纹识别才能进入。
也可以通过第三方应用来实现短信加密，如通过应用锁或者隐私保护应用等，需要注意的是，不同版本的小米手机系统设置可能会有所不同，需要根据具体的手机系统版本和界面设置进行相应的调整，如果在操作过程中遇到问题，可以联系小米客服进行咨询，同时请注意保护个人隐私，谨慎选择加密方式并保管好密码。
