发短信的费用通常是从用户所购买的手机套餐中的短信额度或者余额中扣取的。具体来说，有以下几种情况。
1、短信套餐：大多数手机用户会购买运营商提供的短信套餐，套餐中包含一定数量的短信额度，超出套餐短信数量的短信将会额外计费，从余额中扣除。
2、预付费方式：一些用户可能选择预付费方式购买短信，即先充值一定的金额到账户中，发短信时直接从充值金额中扣除。
3、包月费用：有些短信服务是包含在用户的手机套餐月租费中的，这种情况下发短信不会额外收费。
4、特定应用费用：如果使用特定的应用发送短信，如某些社交应用或企业短信应用，费用可能会直接从与该应用关联的支付方式中扣除，如信用卡、支付宝等。
具体的扣费方式和标准取决于用户所使用的运营商、手机套餐及短信服务类型，如有疑问，建议联系手机运营商客服查询具体费用情况。
