骚扰拦截的短信是否自动清除取决于所使用的手机管家应用或设置。针对苹果手机，可以采取以下步骤进行设置。
1、打开“设置”-“信息”，找到“过滤未知发件人”，开启该功能，这样来自不在通讯录中的短信将被自动拦截并标记为“不在通讯录”或类似的标签，这些短信可以在信息应用中的特定标签下找到，但并不一定会自动清除。
2、对于自动清除短信，苹果手机的iOS系统并没有自带此功能，但可以通过使用第三方应用来拦截并自动删除垃圾短信，可以在App Store中搜索并下载一些骚扰短信拦截应用，这些应用通常提供拦截设置，包括自动删除拦截的短信。
3、一些手机管家应用也具有短信拦截功能，可以在其应用内部设置拦截规则，包括是否自动清除拦截的短信，具体设置方法取决于所使用的应用。
苹果手机可以通过开启过滤未知发件人功能或使用第三方应用来拦截骚扰短信，但不会自动清除这些短信，需要手动进入相应的标签或应用内进行处理，建议根据个人需求和习惯选择合适的设置。
