查询农村信用社扣款短信，可以通过以下几种方式。
1、手机银行查询：开通农村信用社手机银行的账户，在手机上登录手机银行，进入个人账户页面，点击“账户明细”，即可查询到扣款短信的详细内容，包括交易日期、交易金额等信息。
2、微信公众号查询：关注农村信用社的微信公众号，绑定账户后，进入个人账户页面，点击“账户明细”，也可以查询到扣款短信的记录，有些银行公众号还会推送动账通知，第一时间获取账户资金变动信息。
3、拨打客服电话查询：拨打农村信用社的客服电话，根据语音提示提供自己的账号信息，可以查询账户扣款明细，或者转人工服务，请求客服帮助查询账户历史扣款记录。
4、网点柜台查询：携带个人身份证和银行卡到农村信用社的网点柜台查询，柜台人员可以为你打印账户近一段时间的流水明细，包括扣款的明细。
为了保护个人隐私和账户安全，查询账户信息时务必确保网络环境的安全性，如有任何疑问或发现异常，请立即联系农村信用社的客服咨询。
