手机短信莫名其妙消失可能是由于多种原因导致的，以下是一些可能的原因和解决方法。
1、误删：可能是自己不小心误删了短信。
2、自动删除：部分手机自带自动清理功能，可能自动删除了一些短信，可以在手机设置中查看或更改相关设置。
3、存储空间不足：手机存储空间不足时，系统可能会自动删除一些旧短信以腾出空间，可以尝试清理手机存储空间，如删除不必要的应用、视频、图片等。
4、病毒或恶意软件：手机可能遭受病毒或恶意软件的攻击，这些程序可能会删除短信，建议安装最新的安全软件并扫描手机以查找和删除任何恶意软件。
5、系统错误：手机系统出现错误也可能导致短信消失，可以尝试重启手机，或者恢复手机出厂设置（但请注意，这将删除所有数据和设置，建议先备份重要数据）。
6、运营商问题：有时运营商的服务器出现问题也可能导致短信消失，可以联系运营商询问是否有任何已知的问题或正在进行的服务中断。
7、第三方应用冲突：某些第三方应用可能会与短信应用冲突，导致短信消失，可以尝试暂时禁用一些最近安装的应用，看看是否有所改变。
如果以上方法都不能解决问题，建议将手机带到专业的维修店进行检查和修复，为了数据安全，建议定期备份手机数据。
