苹果手机加密短信内容不被发现的方法有多种，以下是一些建议。
1、使用加密应用：在App Store中搜索并下载加密通讯软件，加密通讯”或“隐私保护通讯”，这些应用提供了端到端的加密服务，可以保护您的短信内容不被他人查看。
2、使用手机的原生加密功能：在iOS设置中，为整个短信应用设置密码或使用生物识别技术（如面容ID或指纹）进行加密，但请注意，这种方法需要每次访问短信应用时都输入密码或进行生物识别，相对不太方便。
3、使用隐藏文件夹或应用锁：可以使用一些手机管理工具创建隐藏文件夹或应用锁，将短信应用添加到其中并设置密码，这样，只有知道密码的人才能打开该应用或文件夹查看短信内容。
4、分组加密：对于某些特定的联系人发送的短信，可以选择使用某些加密通讯工具进行一对一的加密通讯，这样只有双方使用相同的工具才能查看短信内容。
无论使用哪种方法，都需要注意以下几点：
选择可信赖的加密应用，确保它们具有良好的评价和信誉。
定期更换密码或使用更复杂的密码组合，以提高安全性。
不要将密码或加密工具的登录信息泄露给他人。
注意备份重要数据，以防万一，虽然加密可以提高安全性，但数据丢失的风险仍然存在。
需要明确的是，没有任何方法可以完全保证信息的安全，在使用手机加密功能时，仍需谨慎处理个人信息和敏感内容。
