如果短信应用从手机桌面上消失了，可能有以下几种原因和解决方法。
1、可能是您不小心将短信应用隐藏了，您可以尝试在桌面上的应用程序列表中找到短信应用，或者尝试使用搜索功能来查找短信应用，有些手机支持将应用程序隐藏，您可以在相关设置中找到恢复显示的方法。
2、可能是短信应用被停用了，您可以尝试进入手机的设置，找到应用程序管理或者应用设置，查看短信应用的运行状态，如果被停用了，可以尝试启用它。
3、可能是桌面布局或主题改变了，导致短信应用的图标无法在当前桌面显示，您可以尝试更换桌面布局或主题，或者重新整理桌面图标，找到短信应用的图标并固定在桌面上。
4、如果以上方法都无法解决问题，可能是短信应用被误删除或者系统出现故障，您可以尝试使用手机的数据恢复功能来找回短信应用，或者重新下载安装短信应用，如果仍然无法解决问题，可能需要考虑重置手机系统或者寻求专业的技术支持。
不同品牌和型号的手机可能存在差异，解决方法也可能有所不同，如果以上方法无法解决问题，建议查阅手机的用户手册或者联系手机制造商的客服支持获取更具体的帮助。
