如果在尝试恢复苹果手机中的短信后，仍然无法看到已删除的短信，可能有以下几种原因。
1、未成功恢复：可能是在恢复过程中出现了问题，导致短信没有成功恢复，可以尝试重新进行恢复操作，确保按照正确的步骤操作。
2、备份问题：如果在恢复之前使用的是备份文件，那么可能是备份文件不完整或者备份时短信已经丢失，可以尝试使用其他备份文件恢复，或者确认备份文件中的短信是否确实存在。
3、软件问题：可能是手机系统或所使用恢复软件的问题，可以尝试更新手机系统或修复软件问题。
4、短信被再次删除：可能在恢复后，又误删了短信或者进行了其他操作导致短信再次消失，这种情况下需要重新尝试恢复或查看是否有其他备份。
如果以上方法都无法解决问题，建议咨询苹果官方客服协助解决，为了避免重要短信的丢失，建议及时备份手机数据。
