设置个别短信加密可以通过以下几种方式实现，但请注意，这些方法的实施可能会因手机操作系统和应用软件的不同而有所差异。这里以安卓和iPhone系统为例进行说明。
1、应用锁：大多数手机都有内置的应用锁功能，可以针对特定的应用进行加密，打开应用锁功能后，进入短信应用时需要验证密码或指纹识别等身份验证方式，这样，即使有人拿到你的手机，也无法查看加密的短信内容。
2、使用第三方加密应用：市面上有很多第三方加密应用，如文件保险柜、隐私保护等，这些应用可以针对特定的短信进行加密，只有输入正确的密码才能查看，使用时，只需将需要加密的短信添加到该应用中即可。
3、使用短信隐藏功能：部分手机支持短信隐藏功能，可以将特定的短信设置为隐藏状态，进入短信应用后，这些短信不会直接显示在主界面上，只有输入密码等身份验证后才能查看。
4、使用短信转移方式：可以通过一些即时通讯工具（如WhatsApp, Telegram等）进行加密通讯，这些工具通常具有端到端加密功能，可以保证通讯内容的安全，将需要加密的短信通过这些工具发送，可以有效保护隐私。
无论采用哪种方法，都要牢记以下几点：
设置的密码要足够复杂，避免使用简单数字或生日等容易被猜到的密码。
定期更换密码，增加安全性。
确保加密应用或功能的更新，以修复可能存在的安全漏洞。
谨慎选择第三方应用，确保应用的信誉和安全性。
需要明确的是，加密短信只能保护信息内容不被未经授权的人查看，不能百分百保证信息安全，在使用时仍需谨慎。
