苹果手机自动删除短信可能有以下几种原因。
1、可能是开启了自动清理功能，特别是iPhone的iCloud功能中的短信同步功能，当iCloud功能开启时，会自动删除旧的短信以保证内存充足，如果想要关闭此功能，可以进入设置，找到Apple ID选项并点击，找到iCloud选项，然后关闭其中的信息同步开关，也可以查看短信是否设置为自动删除模式，如果是的话，建议将其设置为保留模式。
2、手机处于低电量状态，并且开启了低电量模式时，系统会自动删除一些不太重要的短信以节省电量，当充电后或调整设置后，这些短信可能会被恢复。
3、如果手机中存在某些恶意软件或病毒干扰，也可能导致短信被自动删除，此时可以尝试使用杀毒软件进行扫描和清理，也可以尝试将手机恢复出厂设置或更新系统以修复可能的软件问题。
原因仅供参考，如果以上方法无法解决问题，建议咨询苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求专业的帮助和解决方案。
