取消农村商业银行的短信功能，可以按照以下步骤操作。
1、通过银行客服取消：告知银行客服需要取消短信通知服务，验证个人信息和账户信息后，即可取消。
2、通过网上银行取消：登录个人网上银行，找到账户管理或短信通知服务选项，选择关闭短信通知功能。
3、通过手机银行取消：登录手机银行客户端，找到相关设置选项，选择关闭短信通知功能，不同银行的具体操作可能略有不同。
4、前往银行柜台取消：携带有效身份证件和银行卡到附近的农村商业银行网点，告知工作人员需要取消短信通知服务，提供银行卡和身份证进行办理。
需要注意的是，不同的农村商业银行可能在操作细节上存在差异，请根据自己所使用的银行的具体规定进行操作，如有任何疑问，可以拨打农村商业银行客服电话进行咨询。
