使用短信查询行程是否安全取决于服务提供商和您的隐私保护措施。一般来说，大多数手机运营商提供的短信查询服务是安全的，因为这些服务经过了加密和安全验证。然而，为了确保您的隐私安全，您应该注意以下几点。
1、选择可靠的服务提供商：选择官方或知名的服务提供商进行查询，避免使用不可靠的第三方应用程序或服务。
2、确认短信内容：在发送查询行程的短信之前，请确保短信内容清晰明了，并且只包含必要的信息，如您的手机号码和查询请求，避免在短信中包含其他敏感信息。
3、保护个人信息：不要将您的手机号码、密码或其他敏感信息提供给不可信的服务提供商或第三方应用程序，确保您的手机安全，避免丢失或被盗窃。
至于查询行程的方式，通常可以通过以下几种方式进行：
1、手机应用程序：许多手机运营商和航空公司都提供了手机应用程序，您可以通过这些应用程序查询行程信息，这些应用程序通常经过了加密和安全验证，因此相对安全。
2、官方网站：您可以访问相关服务提供商的官方网站，通过输入您的手机号码或其他身份验证信息进行查询。
3、电话查询：如果您担心短信查询不安全，您还可以选择通过电话联系相关服务提供商查询行程信息。
只要您选择可靠的服务提供商并采取适当的保护措施，使用短信查询行程是相对安全的，为了确保您的隐私安全，请始终谨慎处理个人信息并采取必要的安全措施。
