如果红米手机桌面上的短信图标消失了，可能是由于应用程序被隐藏、系统错误或误删等原因造成的。以下是一些可能的解决方法。
1、检查应用程序是否被隐藏：在红米手机中，用户可以选择隐藏某些应用程序，如果短信应用程序被隐藏了，那么它的图标就不会在桌面上显示，可以进入设置，找到应用管理或应用程序菜单，查看被隐藏的应用程序并取消隐藏。
2、重启设备：有时候设备出现一些小问题，简单的重启往往能解决很多问题，尝试重启一下手机，看看短信图标是否重新出现。
3、恢复桌面布局：如果使用了特定的桌面主题或布局应用，可能会导致某些应用图标消失，可以尝试更换桌面主题或者恢复默认桌面布局，看看是否可以找回短信图标。
4、使用全局搜索功能：在红米手机上，可以使用全局搜索功能来查找短信应用，如果在桌面上找不到短信图标，可以尝试使用全局搜索功能来查找并启动短信应用，如果能够成功启动短信应用，但图标仍然不显示在桌面上，可能需要进一步的操作来修复这个问题。
5、检查应用是否被卸载或停用：进入手机的设置，找到应用管理或应用程序菜单，查看短信应用是否被卸载或停用，如果是这个原因导致的图标消失，重新安装或启用短信应用即可。
6、恢复出厂设置：如果以上方法都无法解决问题，可以尝试恢复出厂设置来解决这个问题，但请注意，这将删除手机上的所有数据，所以在执行此操作之前，请务必备份重要数据。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系小米的官方客服或者前往小米的维修点寻求专业的帮助。
