要在农村商业银行设置短信通知，您可以按照以下步骤操作。
1、携带有效身份证件和银行卡前往附近的农村商业银行网点。
2、告知工作人员您需要办理短信通知业务，他们将会指导您填写相关的申请表格。
3、提供您的手机号码，以确保短信能够准确发送到您的手机上。
4、根据银行的提示，确认短信通知服务的费用，并确认开通该服务。
5、设置好通知起点金额（当账户余额变动超过一定金额时，银行将发送短信通知）。
6、签署协议并缴纳相关费用后，即可完成短信通知业务的开通。
不同地区的农村商业银行可能有不同的操作步骤和要求，建议您提前咨询当地银行的工作人员，了解详细的信息，随着移动金融的发展，部分银行也提供了网上银行或手机银行的APP进行在线办理，您也可以通过相应渠道进行在线设置。
开通短信通知后，您将在银行账户发生重要变动时及时收到短信通知，确保账户安全并随时掌握账户动态。
