如果您在iPhone上删除了短信，但仍然看到短信应用中的红色标记或未读标记，这可能是因为以下原因。
1、通知设置：即使您删除了短信，通知中心的通知可能仍然存在，您可以前往“设置”>“通知”，找到“信息”应用，并关闭相关的通知标记。
2、未读短信提醒：如果您的iPhone设置了未读短信提醒功能，即使您已经删除了某些短信，系统仍会标记这些短信为未读状态，您可以检查并调整短信应用的设置，关闭未读提醒功能。
3、软件问题或缓存问题：有时，iPhone的短信应用可能会出现缓存问题或软件问题，导致删除后的短信仍然显示标记，您可以尝试重启设备或重置短信应用设置来解决这个问题，如果问题仍然存在，可能需要考虑恢复设备或联系苹果官方客服寻求帮助。
建议是基于一般的iPhone操作系统和短信应用行为，不同版本的操作系统或第三方应用可能会有所不同，如果您使用的是特定的第三方短信应用，建议查看该应用的设置和帮助文档以获取更准确的解决方案。
