要直接删除苹果手机上的短信并且不留痕迹，可以通过以下步骤操作。
1、打开短信应用。
2、找到要删除的短信，长按该短信。
3、在弹出的选项中选择“删除”或“删除会话”。
4、根据提示确认删除操作。
一旦短信被删除，就无法通过常规手段恢复了，除非之前已经备份，在删除之前，请确保不需要这些短信，如果手机设置了iCloud备份，删除的短信可能会在备份中仍然保留，如果需要彻底删除并避免在备份中找到，可能需要使用专业的数据清除工具，但这通常涉及到更复杂的技术操作。
操作仅供参考，如果遇到问题，建议咨询苹果官方客服。
