苹果手机查询已删除的短信可以通过以下几种方法。
1、iMessage信息恢复：如果删除的短信是通过iMessage发送的，可以尝试登录iCloud账户，在iCloud中打开信息应用，从那里找到已删除的短信，如果在删除前开启了iCloud备份功能，那么可以通过备份恢复已删除的短信，具体操作步骤如下：登录iCloud账户后，打开信息应用，找到左上角的“设置”图标并点击，找到并开启“同步此iPhone”，完成同步后，可以在短信应用中查看所有短信记录。
2、iTunes备份恢复：如果使用了iTunes备份手机数据，可以通过iTunes备份恢复已删除的短信，具体步骤包括连接苹果手机到电脑、选择iTunes上的设备图标并点恢复备份的选项等，但这种方法可能无法直接查看具体的已删除短信内容，只能看到备份中的全部数据。
3、专业软件恢复：可以使用专业的数据恢复软件来找回已删除的短信，例如通过数据线连接手机后，根据软件界面提示选择“开始扫描”并等待扫描结果出来后在短信的类别中找到需要恢复的短信进行勾选并点击恢复即可，这种方式需要一定的技术基础，并且可能需要付费。
需要注意的是，以上方法不能保证一定可以找回所有已删除的短信，因为数据恢复的成功率取决于多种因素，如数据被覆盖的情况等，在操作任何恢复步骤之前，请确保了解相关风险并确保手机数据安全，如有更多问题，可以咨询苹果官方客服以获得更多帮助。
